Une fois les Romains partis de Massada, la forteresse est restée inhabitée pendant quelques siècles. Pendant le 5e siècle de l'ère commune, les Byzantins ont construit un monastère sur Massada, mais avec l'arrivée de l'islam au cours du septième siècle, le monastère cessa d'exister.

Une des découvertes les plus fantastiques est un ensemble de 11 pièces en argile, chacune avec une inscription dans la langue hébraïque. D'après le livre de Flavius Josèphe, le suicide collectif des rebelles juifs a été réalisé par 10 hommes qui ont été choisis par tous. Les dix derniers rebelles ont utilisé la même règle pour chacun d'entre eux, “que celui choisi devrait d'abord tuer les neuf autres avant de se donner lui-même la mort… Ils sont morts avec la croyance qu'ils n'avaient laissé personne vivant qui puisse tomber entre les mains des Romains”. Ces pièces d'argile trouvées par la délégation d'Yadin sont crues être les dernières pièces utilisées pour le tirage au sort des dix dernières personnes. Sur l'une des pièces, il y a écrit Ben Yair, le nom du chef des rebelles.